Przystanek kolejowy PKP Warszawa Płudy zlokalizowany jest przy ulicy Czołowej, na granicy Henrykowa i Białołęki Dworskiej. Od 2012 roku nad torami przystanku przechodzi wiadukt drogowy, w miejscu w którym ulica Bohaterów łączy się z ulicą Klasyków. Z wiaduktu drogowego prowadzą schody i windy, którymi pasażerowie przemieszczają się pomiędzy środkami komunikacji kołowej i szynowej.
Przystanek kolejowy Warszawa Płudy został całkowicie zmodernizowany w ostatnim dziesięcioleciu. Obecnie to typowy "unijny" przystanek kolejowy charakterystyczny dla kolejowego budownictwa z początku XXI wieku.
Pasażerowie przystanku mają do swojej dyspozycji dwa perony jedno-krawędziowe położone naprzeciw siebie. Przejście pomiędzy peronami jest możliwe tylko poprzez wiadukt drogowy. Na przystanku zatrzymują się wyłącznie pociągi SKMWA (linia S3 i S9) oraz pociągi KMKOL.
Przystanek Warszawa Płudy położony jest na międzynarodowej linii kolejowej E-65. Przez przystanek przejeżdżają pociągi dalekobieżne IC zmierzające m.in. w kierunku Gdańska oraz pociągi towarowe. Dla ruchu tych pociągów przeznaczony jest trzeci tor położony w środku torowiska.
